碗莲有无性繁殖和有性繁殖两种。有性繁殖即用种子直播,但容易产生变异,在育种上应用较多;日常繁殖以无性繁殖为主,即通过碗莲的苫芽发育成新的个体。长江流域一般在清明前后翻盆分藕,注意切勿损伤顶芽。种藕至少要保留两段藕身,尾部留节。留有节的种藕栽后藕身腐烂缓慢,能为荷花发芽展叶提供足够的养分。通常碗莲种植在小钵内,受营养条件的限制,繁殖系数较低。为了加速繁殖,可种在较大的钵内,促使地下茎多分枝,提高繁殖率。