木槿花在生长期间病虫害比较少，其中病害主要有炭疽病、叶枯病、白粉病等；虫害主要有红蜘蛛、蚜虫、蓑蛾、夜蛾、天牛等。当病虫害发生时，可剪除病虫枝，选用安全、高效低毒农药喷雾防治或诱杀。应注意早期防治，避免在开花采收期施药，保证采收的木槿花不受农药污染。
木槿花常遇到斑病和锈病危害，可用65%代森锌可湿性粉剂600倍液喷洒。虫害还有粉虱和金龟子，以蚜虫为主，也有尺蠖和卷叶蛾，可用40%氧化乐果乳油1000倍液喷杀。对环境安全的除虫法是用稀释后的洗涤剂。